ここ数年で急に出てきた言葉、おそらくウェブの発展によって広まったんでしょうね、ですのでまだ世間に完全に浸透したとは言えない言葉です。
　従って親切なサイトでは「FAQ（よくある質問）」と括弧書きがついてます。略した甲斐ないじゃん。
　しかし一位が「エフエーキュー」なのはいいとして、二位の「ファッキュー」って「ファック」よりまずくないですか？

　てなわけで何一つ意見はまとまりませんでしたが、

　日本の標準は「FAQはエフエーキューと読む」に決定いたしました。